В соответствии с Уставом МБОУ "Навлинская ООШ" вправе самостоятельно формировать структуры органов управления Учреждения, если иное не установлено федеральными законами.
Управление Учреждением осуществляется на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.
Единоличным исполнительным органом Учреждения является директор, который осуществляет текущее руководство деятельностью Учреждения.
В образовательном Учреждении формируются коллегиальные органы управления, к которым относятся Общее собрание работников Учреждения, Педагогический совет, Управляющий совет.
В целях учета мнения обучающихся создается Совет обучающихся, который осуществляют свою деятельность на основании законодательства Российской Федерации и соответствующих положений, утверждаемых Руководителем Учреждения.
В целях содействия Учреждению в осуществлении воспитания и обучения детей в Учреждении создаются Родительские комитеты классов и Родительский комитет Учреждения.